荷兰人的妥协及叶尔羌汗国的俯首，都令大明的势力向东西两处地方大大的深入了。

　　和巴达维亚的妥协相比，朱由检显然更中意听到叶尔羌汗国臣服的消息。这比他原本预料中的征战时间要少的多，且耗费的物资也出乎意料的低。

　　更为重要的是，和内蒙、宁夏相比，西域可供开发的土地要更为广阔，且自然条件也更好。

　　且随着大明对于河套地区的开发，鼠疫正日渐成为西北屯垦区的一大疾病。河套地区的草原和沙漠地带，原本是鼠类及旱獭等小动物的领地。

　　随着大明组织流民前往开垦这些地区的土地之后，便增加了鼠疫传播的风险。就在前两年，宁夏地区的乡村中老鼠陡然增多，当时地方官员不过将之视为了一种凶兆，但是随着去年这些地区的乡村开始出现极为凶猛的传染病后，朱由检便立刻反应了过来，这是鼠疫爆发了。

　　被称为黑死病的鼠疫，在这个时代可是比天花还要恐怖的瘟疫，一旦感染就意味着死亡。甚至于这个时代最高明的医生，对于鼠疫的发生和传播形态，还不及朱由检知道的多。

　　拜后世发达的网络信息所赐，朱由检起码还知道鼠疫是一种细菌传染的疾病，而不是什么瘟神降下的灾祸。他最起码还知道，这是通过动物身上的鼠蚤传播给人类的，而得病之后的人类又很快会通过呼吸及身体的接触，传染给其他人。

　　正因为崇祯的坚持，太医院的医生们才没有再试图用伤寒论去解释西北出现的瘟疫。借助显微镜研究医学的吴有性等医生们，认同了皇帝的主张，认为这有可能是一种新的细菌致病原理，同伤害病决不类同。

　　但是吴有性也坚决反对崇祯所采取的只防不治的措施，这些措施有：通过设立西北防疫处，对于宁夏、河套平原、鄂尔多斯高原、呼和浩特等地进行严密封锁，禁止病疫发生地区的人群向外流动，焚毁该地区内一切人畜尸体，及鼠类、旱獭的皮毛，禁止该地区百姓食用老鼠及旱獭等动物等。

　　对于以上这些预防和隔离措施，其中很大一部分参照了伦敦对付黑死病的武力隔离措施。可吴有性认为，只预防而不采取治疗的手段，这无疑就等于是抛弃了那些疫区的百姓。

　　这样的隔离措施延续下去，恐怕百姓今后会将对于疾病的恐惧，转变成对于病人的痛恨，这显然是不正常的，也有违他们这些医者学医的初衷。因此他坚持要求带队前往疫区，对鼠疫发病的原因和传播方式进行彻底的研究。

　　朱由检注视着面前的吴有性认真的说道：“虽然我不能告诉你，关于鼠疫的传播方式来自于那本书。

　　但是这些天你们和那些欧洲传教士的探讨，也应当知道黑死病其实就是鼠疫，它的传播方式就已经足以证明

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